|
|
Influence of aminoacid side-chain ionization on protein structure
Tomanová, Ema ; Nová, Lucie (vedoucí práce) ; Muzdalo, Anja (oponent)
Protein folding je ovliňován různými typy interakcí. Krom hydrofobních sil a vodíkových vazeb při něm hrají důležitou roli také Coulombické síly. Jejich důležitost vyvstává hlavně v částečně rozvinutých stavech a regionů citlivých na změny v pH, tam může ionizace postranních řetězců aminokyselin způsobovat konformační změny. Lepší porozumění funkci ionizovatelných postranních řetězců v protein foldingu otevírá nové příležitosti v designu proteinů a modifikacích zlepšujících jejich vlastnosti.
|
|
|
Molecular Simulation of Electrospinning.
Jirsák, Jan ; Moučka, F. ; Nezbeda, Ivo
Our recent attempts to apply standard molecular simulation techniques to the process of electrospinning are presented. We employ a molecular dynamics simulation to study phenomena involved in the electrospinning of polymer solutions, with particular attention to the formation of the Taylor cone and the development of a liquid jet. A molecular-based approach allows us to reveal the molecular structure and dynamics, which are inaccessible to continuum methods.
Plný tet: SKMBT_22317031713170 -  PDF
Plný text: content.csg - PDF
|
|
|
Pokroky v popisu termodynamických vlastností soustav obsahujících alkanoly
Aim, Karel ; Nezbeda, Ivo
Nastíněny jsou dvě linie výzkumu zaměřeného na využití tzv. primitivních modelů asociace k popisu termodynamických vlastností alkanolických soustav: (i) molekulární simulace směsí voda a methanol a (ii) vývoj stavových rovnic pro soustavy typu alkanol a oxid uhličitý. Molekulární simulace směsí voda a methanol byly provedeny s použitím primitivních modelů, které vycházejí z realistických modelů mezimolekulárních interakcí pro obě složky. Výsledky pro dodatkové směšovací i parciální molární vlastnosti soustav pro celý koncentrační rozsah byly porovnány s výsledky molekulárních simulací pro obecně přijímané komplexní realistické modely (efektivních párových interakcí) a s experimentálními daty. Vývoj stavových rovnic pro soustavy typu alkanol a oxid uhličitý vycházející z poruchového rozvoje okolo referenční tekutiny s krátkodosahovými interakcemi je založen na využití nedávno naměřených souborů experimentálních dat pro tyto soustavy
|
|
| |
host ::
RSS.